24 декабря 2010 года в ФГОУ ВПО Башкирский ГАУ сертифицирована система менеджмента качества университета применительно к разработке и предоставлению образовательных услуг по программам высшего профессионального образования на соответствие требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2008 (ИСО 9001:2008) регистрационный номер РОСС RU.ФК68.К00004.

Получение сертификата подтверждает гарантированное высокое качество образования в университете и обеспечивает преимущество на рынке образовательных услуг, как самого вуза, так и его выпускников. Внедрение и сертификация системы менеджмента качества является для всего коллектива университета стимулом для постоянного улучшения и совершенствования всех видов деятельности и позволит повысить статус и доверие потребителей к деятельности университета.